從實驗室到Nature子刊,他說在復旦可以“全身心沉浸科研”


秋日的復旦園里,“相輝同游”第二期午餐會正在舉行。2022級計算與智能創新學院本科生韓創意作為國家自然科學基金委青年學生項目(本科生)(下文簡稱:國自然本科生項目)獲得者,為相輝學堂的學弟學妹帶來了一場輕松而充實的分享。

從AI大模型的工業落地挑戰,到細胞數據的解析技巧,從課程選擇策略到科研心態的培養,都知無不言,也讓人不禁好奇:他是如何在短短兩年里,從科研“小白”成長為一位手握國家級科研項目、以第一作者身份在《自然·機器智能》(Nature Machine Intelligence)發表論文的直博生?
在復旦,科研之門為本科生早早打開
韓創意的科研之路,始于大二下學期。在一次國際人類表型組大會上,他作為志愿者負責接待一位美國科學院院士。“在陪同的一個小時里,我們聊科研、談人生,那位院士告訴我:‘趁著現在平臺好,早點開始做科研,而且要做就做最前沿的。’”
這個建議如同在年輕學子心中種下了一顆種子。回到校園后,韓創意立即開始尋找研究方向,最終鎖定了空間組學這個前沿領域。更讓他驚喜的是,在復旦,這個領域的前沿學者就在身邊。

“我很快發現原致遠研究員正是這一領域的前沿學者,恰逢原老師開設相關課程。”隨即,韓創意便主動選課,隨后加入課題組,開啟了“空間組學與人工智能交叉領域”的探索。
“不要認為自己基礎差、還沒準備好,”回顧自己的起步,他對學弟學妹這樣建議,“找到一個感興趣的方向后,盡快聯系老師,早點開始,在實踐中學習是成長最快的方式。”
復旦的科研訓練體系,為他這樣的探索者提供了堅實的第一級臺階。在導師指導下,他先主持了復旦大學“復芏計劃”下設的“?政項目”——大規模空間組學數據細胞微環境識別模型開發,并以優秀結題。這個“量身打造”的入門項目,讓他初探科研訓練,掌握領域內的基本計算工具,對科研流程也有了把握。
從Nature子刊到國自然本科生項目,品味與毅力是關鍵詞
扎實的入門訓練后,韓創意迎來了第一個重大挑戰——探索自監督學習模型從單細胞數據到空間轉錄組數據的可遷移性。這項研究最終被《自然·機器智能》(Nature Machine Intelligence)接收,他也成為了中國首位以本科生第一作者身份在該刊發表研究論文(Research Article)的學生。
然而,科研之路從不平坦。
“投稿后,因為我們的研究相對整個領域較為前沿,有審稿人對我們的部分研究動機與技術細節提出了一系列疑問。”韓創意回憶道。
面對挑戰,他和團隊沒有退縮。他們花了整整兩個月,寫了六十多頁相當于中文十多萬字的審稿意見回復信,回憶起這段經歷,韓創意感觸頗深。“我們針對審稿意見補了七八個實驗,從理論和實驗兩個層面有力回應了審稿人的疑問。”
“這個過程讓我深刻體會到,選擇一個有價值的科學問題,就像扣好科研的第一粒扣子。”韓創意說,“問題選對了,后續的努力才會水到渠成。這種對問題價值的判斷,就是科研的‘品味’與‘眼光’。”

“世界上最偉大的科學家和藝術家,都在做著突破認知與審美界限的事情。”他進一步說,“愛因斯坦、達芬奇如此,今天的科研工作者亦然。”
這份在實戰中磨練出的“品味”與堅韌,也成為他獲得“國自然”本科生項目青睞的關鍵。他成功申請到面向空間組學數據相關項目。
他用一個生動的類比解釋自己的研究:“就像我們既有圖片又有文字,希望把兩者對齊、互相生成。我們的目標是整合RNA、蛋白質等不同模態的空間數據,構建一個‘虛擬空間多組學圖譜’,相當于為研究者提供一組多視角的‘計算顯微鏡’,更全面地洞察生命機制。”
如果項目推進順利,將突破當前實驗技術的限制,從計算方法上實現對細胞狀態與微環境更全面的洞察,為腫瘤免疫、神經退行性疾病、發育生物學等前沿領域提供新的分析工具。
復旦土壤,托舉本科生的科研夢想
韓創意的快速成長,并非孤例,其背后是復旦大學為本科生科研構建的豐沃土壤。
“在復旦,本科生能夠獲得這樣強大的導師團隊指導,這是非常難得的機會。”韓創意稱自己是幸運的,除了原致遠的指導外,他也曾接受中國科學院院士金力、計算與智能創新學院首席教授施伯樂的指導。
“兩位老師都十分樂意給我這個科研新手一些高屋建瓴的建議,而原致遠老師則提供了更具體的指導。”

“原老師會非常看重實驗結果背后的科學邏輯以及對實驗結果的呈現方式。”韓創意說,“老師要求我們每一張圖表都需要準確、清晰地傳達科學發現,不能有任何含糊或誤導。督促我們常思考和反復推敲:這個數據真正說明了什么?這樣呈現是否能讓同行準確理解我們的發現? 所以,我們每一張圖可能都會要改個十幾版最后才將它呈現在論文當中。”這種對科學嚴謹性的執著追求,也讓韓創意明白科研不僅要做得扎實,更要對自己的每一個結論以及科研成果的傳播負責。
在論文寫作中,原致遠也特別強調邏輯線的把握。“我們可以語言不夠流暢,但是邏輯一定要把握得非常清晰。”這種訓練讓韓創意認識到,動機闡述和邏輯清晰是一篇論文最重要的兩個支點。
他特別提到《計算機組成原理》課程的授課教師張為華。“老師允許我們把更多時間投入科研探索,這種包容對我們非常重要。”這種鼓勵學生追求個性化發展的氛圍,在復旦的課堂上并不少見。
“在復旦,開放的學術交流,也極大地拓展了我的學術視野,幫助我錨定前沿方向。”通過“復芏計劃”等平臺,韓創意可以接觸到各類前沿學術報告。無論是作為志愿者還是聽眾參與高端學術會議,都可以讓他收獲滿滿。
希望未來能構建“虛擬細胞”系統
被問及“典型的科研日常”時,韓創意描述得簡單而專注:早上九點前到工位,看文獻、跑實驗、調試代碼、整理結果,晚上十一點左右離開。“一周大概工作六到七天。基本上除了休息,就是泡在工位上。”他笑著說。

入選“國自然”本科生項目后,他對未來的科研道路更加清晰。如今,他已入選復旦大學類腦智能科學與技術研究院2026級直博生,將在空間多組學與人工智能的交叉領域繼續深耕。他希望未來自己能夠,參與到構建“虛擬細胞”甚至“虛擬人體”的宏偉目標中,“為理解生命、對抗疾病提供全新的視角和工具。”
在這個系統中,許多實驗無需在實體動物或人體上進行,這將極大推進醫學發展和生命機制的理解。“這是一個最終極的目標,”他笑著說,“還有非常多人都在為著這樣一個目標所努力。我也希望自己在這個過程突破一些認知上的界限,開拓一些知識的荒原”。
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